Buenos días,
somos cientos de personas las que estamos participando en este MOOC, con muy diversas experiencias y lugares de origen. Por eso quería abrir este debate, para preguntaros por vuestras experiencias con la identificación de patógenos de transmisión vectorial. Por ejemplo, si trabajáis en algún laboratorio qué técnicas usáis, si alguna vez os han diagnosticado alguna enfermedad y sabéis cómo lo hicieron, tipo de muestras…
En mi grupo de investigación trabajamos mucho con malaria aviar (Plasmodium spp.) y frecuentemente testamos la presencia de ADN de estos parásitos en mosquitos y aves. Para los mosquitos solemos hacer pooles, es decir, agrupar diferentes individuos en una misma muestra, de forma que se aumenta la probabilidad de detección del parásito con menos recursos. Para las aves, usamos muestras de sangre individuales. El proceso es similar en ambos casos: primero extraemos el ADN de cada muestra y posteriormente realizamos una PCR para amplificar un gen del parásito, el gen cyt b . Esto nos permite identificar cualitativamente qué muestras tienen ADN del parásito, mediante un gel de agarosa. Posteriormente, secuenciamos las muestras positivas y obtenemos la secuencia de este gen, pudiendo identificar los diferentes linajes usando herramientas online como BASTn o MalAvi (esta última específica para malaria aviar).
Esta es mi experiencia, os animo a contar las vuestras!