La búsqueda global no está activada.
Salta al contenido principal
Foro

Cafetería

Formación en Bioinformática

Formación en Bioinformática

de Pedro Carmona - Número de respuestas: 6

La Bioinformática es una disciplina que integra conocimientos de diversas áreas, principalmente Biología, Informática y Estadística. Es un campo también muy amplio, que abarca desde el análisis de datos para extraer información en áreas muy diversas (biología estructural , bioinformática clínica, evolución, análisis de genomas, etc) hasta el desarrollo de nuevas metodologías y software para la gestión y análisis de datos.
En este sentido, la oferta de cursos y titulaciones específicas va aumentando debido a la demanda que también tiene esta disciplina. Como en este curso estáis estudiantes y profesionales de perfiles muy diversos, ¿qué consideráis importante a nivel de formación para trabajar en Bioinformática?
---------------------
Bioinformatics is a discipline that integrates knowledge from different areas, mainly Biology, Computer Science and Statistics. It is also a very broad field, ranging from data analysis to extract information in very diverse areas (structural biology, clinical bioinformatics, evolution, genome analysis, etc.) to the development of new methodologies and software for data management and analysis.
In this sense, the offer of specific courses and degrees is increasing due to the demand that this discipline also has. As this course includes students and professionals with very diverse profiles, what do you consider important in terms of training to work in Bioinformátics?

En respuesta a Pedro Carmona

Re: Formación en Bioinformática

de Cristian Molinares Pacheco -
Hola Pedro,
Sin duda la bioinformática tiene bases multidisciplinares.
Siendo yo un principiante en el uso de herramientas bioinformáticas considero que es imprescindible tener conocimiento en biología molecular y estar abiertos a la formación en herramientas de programación. De igual manera, creo que cualquier profesional partiendo de una de estas tres áreas que has mencionado (Biología, informática y estadística) y teniendo nociones sobre las otras dos puede darle una mirada distinta a cada problema, y eso hace que la bioinformática pueda ser utilizada desde estas áreas del conocimiento.
En respuesta a Pedro Carmona

Re: Formación en Bioinformática

de Jose M Peregrin Alvarez -
Muy buenas. Considero que el Machine Learning, el Big Data, la Inteligencia Artificial y los grandes modelos de lenguaje (LLMs) son tecnologías que ya deberían estar plenamente integradas en la Bioinformática. Por el título del curso, imagino que las dos primeras están bien cubiertas, y espero que también se toquen las otras para obtener una visión más completa y alineada con la realidad actual. Saludos, J
En respuesta a Pedro Carmona

Re: Formación en Bioinformática

de Ignacio Montero Ordóñez -
En mi opinión, para trabajar en bioinformática es necesario conocer tanto cómo trabaja la biología como el lenguaje de las máquinas. Los bioinformáticos trabajamos como traductores, como embajadores entre ambos mundos. Es importante que desarrollemos competencias que nos ayuden a pensar como biólogos y como máquinas, lo que en muchas ocasiones es complicado. En ocasiones carecemos de los conocimientos matemáticos, sobre todo si venimos del mundo Bio. Considero que adquirir estos conocimientos.
En respuesta a Pedro Carmona

Re: Formación en Bioinformática

de Miquel Romero Obón -
Entiendo la Bioinformática como la fusión de dos disciplinas que hacen que su suma esté por encima de la simple adición. Sin ánimo de polemizar, siempre he pensado que estas disciplinas son las relativas al mundo de la salud y las matemáticas. La informática es el medio.
Quizás influya en mi pensamiento la existencia de otras excelentes hibridaciones que percibo cercanas. Por citar alguna de ellas, la quimiometría. Ciencias químicas y Estadística bien maridadas, con ese pegamento que nos dieron los ordenadores, la Informática.
En respuesta a Miquel Romero Obón

Re: Formación en Bioinformática

de Pedro Carmona -
Hola,
Son muy interesantes todos estos comentarios. Como bien comentáis, la bioinformática está en la frontera entre la informática, estadística y ciencias de la vida. De hecho, puede tener una más peso que la otra. Se puede entender como una disciplina que resuelve problemas biológicos usando técnicas de informática y estadística, pero también como una disciplina que desarrolla nuevas metodologías, algoritmos y software inspirados por problemas existentes en el campo de la biología.
Y como mencionáis, podemos incluir en este debate otras disciplinas similares
-------------------------
Hello,
All these comments are very interesting. As you well comment, bioinformatics is on the border between computer science, statistics and life sciences. In fact, it can have one more weight than the other. Iit can be understood as a discipline that solves biological problems using computing and statistical techniques, but also as a discipline that develops new methodologies, algorithms and software inspired by existing problems in the field of biology.
And as you mention, we can include in this debate other similar disciplines
En respuesta a Pedro Carmona

Re: Formación en Bioinformática

de Coral del Val Muñoz -
A lo largo de la discusión, habéis destacado distintos aspectos clave para la formación en este ámbito, subrayando tanto las necesidades técnicas como las conceptuales.

1. La importancia de la Biología Molecular y la Programación

Un punto de consenso es la necesidad de poseer conocimientos en Biología Molecular y estar abiertos a aprender herramientas de programación. Para aquellos que provienen de la biología, la capacitación en lenguajes como Python o R es esencial para analizar grandes volúmenes de datos. De igual manera, los informáticos deben familiarizarse con conceptos biológicos para comprender mejor los problemas a resolver.

2. Inteligencia Artificial, Big Data y Machine Learning en Bioinformática

Se resaltó la creciente integración de tecnologías como el Machine Learning, Big Data e Inteligencia Artificial en la Bioinformática. Estas herramientas han demostrado su utilidad en el análisis de datos ómicos, la predicción de estructuras proteicas (como el caso de AlphaFold) y la identificación de patrones en grandes conjuntos de datos biológicos. Se sugiere que la formación en Bioinformática contemple estas áreas para mantenerse alineada con las tendencias actuales.

3. Bioinformática como puente entre Biología y Computación

Otro de los aspectos destacados es el papel del bioinformático como un "traductor" entre el lenguaje de la biología y el de las máquinas. Esta función requiere desarrollar una mentalidad flexible, capaz de interpretar problemas biológicos en términos computacionales y viceversa. No obstante, se ha enfatizado la falta de formación en matemáticas entre aquellos que provienen del mundo biológico, lo que podría representar una barrera en ciertas áreas de la disciplina.

4. Bioinformática como intersección de Salud y Matemáticas

Un punto interesante que se planteó es que, más allá de la informática como medio, la Bioinformática puede entenderse como la intersección entre ciencias de la salud y matemáticas. Este enfoque refuerza la idea de que el análisis cuantitativo y la modelización estadística son claves en la interpretación de datos biológicos, similar a otras hibridaciones exitosas como la quimiometría.


En general, parece que estamos de acuerdo en que la bioinformática es una disciplina que está en constante evolución y que requiere una formación diversa y adaptativa.
--------------------

Throughout the discussion, you have highlighted various key aspects of training in this field, emphasizing both technical and conceptual needs.

1. The Importance of Molecular Biology and Programming

A common point of agreement is the need to have knowledge of Molecular Biology and be open to learning programming tools. For those coming from a biology background, training in languages such as Python or R is essential for analyzing large volumes of data. Likewise, computer scientists must familiarize themselves with biological concepts to better understand the problems they aim to solve.

2. Artificial Intelligence, Big Data, and Machine Learning in Bioinformatics

The increasing integration of technologies such as Machine Learning, Big Data, and Artificial Intelligence in Bioinformatics was emphasized. These tools have proven useful in omics data analysis, protein structure prediction (as seen with AlphaFold), and pattern identification in large biological datasets. It is suggested that Bioinformatics training include these areas to stay aligned with current trends.

3. Bioinformatics as a Bridge Between Biology and Computing

Another highlighted aspect is the role of bioinformaticians as "translators" between the language of biology and that of machines. This function requires developing a flexible mindset capable of interpreting biological problems in computational terms and vice versa. However, the lack of mathematical training among those coming from a biological background has been emphasized, as this could be a barrier in certain areas of the discipline.

4. Bioinformatics as an Intersection of Health and Mathematics

An interesting perspective raised is that, beyond computing as a medium, Bioinformatics can be understood as the intersection of health sciences and mathematics. This approach reinforces the idea that quantitative analysis and statistical modeling are key to interpreting biological data, similar to other successful hybrid disciplines such as chemometrics.


Overall, it seems we agree that Bioinformatics is a constantly evolving discipline that requires diverse and adaptive training.