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Module 2 discussion forum

No encuentro las librerías en el CRAN

No encuentro las librerías en el CRAN

by José Luis Gutiérrez Espinosa - Number of replies: 3

Hola, seguramente estaré haciendo algo mal pero no sabría el qué. Estoy intentando instalar las librerías de TCGAbiolinks, SummarizedExperiment y limma y no las encuentro en el CRAN, ¿podríais ayudarme?.


Gracias,

un saludo.

In reply to José Luis Gutiérrez Espinosa

Re: No encuentro las librerías en el CRAN

by Raquel Sorribes Dauden -
Hola, si las instalas desde Rstudio funciona, eso sí, hay que tener Rtools
Yo he ejecutado esto y las he podido descargar:
install.packages("BiocManager")
install.packages(c("scales", "pheatmap", "DT", "factoextra", "BiocManager"))
BiocManager::install(c ("NOISeq", "ComplexHeatmap", "TCGAbiolinks", "limma"))
BiocManager::install(c("clusterProfiler", "org.Hs.eg.db", "DOSE", "enrichplot"))