Hola, seguramente estaré haciendo algo mal pero no sabría el qué. Estoy intentando instalar las librerías de TCGAbiolinks, SummarizedExperiment y limma y no las encuentro en el CRAN, ¿podríais ayudarme?.
Gracias,
un saludo.
In reply to José Luis Gutiérrez Espinosa
Re: No encuentro las librerías en el CRAN
by Raquel Sorribes Dauden -Hola, si las instalas desde Rstudio funciona, eso sí, hay que tener Rtools
Yo he ejecutado esto y las he podido descargar:
install.packages("BiocManager")
install.packages(c("scales", "pheatmap", "DT", "factoextra", "BiocManager"))
BiocManager::install(c ("NOISeq", "ComplexHeatmap", "TCGAbiolinks", "limma"))
BiocManager::install(c("clusterProfiler", "org.Hs.eg.db", "DOSE", "enrichplot"))
Yo he ejecutado esto y las he podido descargar:
install.packages("BiocManager")
install.packages(c("scales", "pheatmap", "DT", "factoextra", "BiocManager"))
BiocManager::install(c ("NOISeq", "ComplexHeatmap", "TCGAbiolinks", "limma"))
BiocManager::install(c("clusterProfiler", "org.Hs.eg.db", "DOSE", "enrichplot"))
In reply to Raquel Sorribes Dauden
Re: No encuentro las librerías en el CRAN
by José Luis Gutiérrez Espinosa -Correcto, Raquel, ya he conseguido instalarlos.
Gracias.
Gracias.
In reply to José Luis Gutiérrez Espinosa
Re: No encuentro las librerías en el CRAN
by IRENE C.ESPINEL -Como te comenta Raquel es necesario instalar BiocManager que te permite instalarte paquetes de bioconductor como limma https://rpubs.com/DeepenData/r00-instalacion-paquetes
