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Module 2 discussion forum

Descarga datos TCGA-SKCM

Descarga datos TCGA-SKCM

by Raquel Sorribes Dauden - Number of replies: 2

Hola, soy Raquel, estoy intentando hacer los exjercicios desde R instalado en mi pc pero me da error al descargarme los datos (adjunto pantallazo más abajo).

¿Alguna idea?

Gracias,


Raquel



In reply to Raquel Sorribes Dauden

Re: Descarga datos TCGA-SKCM

by Pedro Carmona -
Hola Raquel
Se descarga más de 400 archivos, 200MB de datos, y según la conexión puede dar problemas
En estos casos intenta descargar en tandas de n archivos usando el argumento files.per.chunk, por ej, GDCdownload(query, files.per.chunk = 10) te descargará de 10 en 10
Un saludo


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Hi Raquel
This function downloads more than 400 files, 200MB of data, and depending on the connection it can give some errors.
In these cases try to download in batches of n files using the argument files.per.chunk, e.g. GDCdownload(query, files.per.chunk = 10) will download 10 at a time.
Best