¿Qué rol pensáis que ha jugado la bioinformática en la lucha contra el SARS-CoV2 y la pandemia de COVID19 que ha producido?
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Buenas noches,
A lo largo de la pandemia se ha producido un acercamiento entre los profesionales sanitarios y la información del estado, salud y monitorización del paciente. Además de la comunicación mundial entre los profesionales sanitarios acerca de pruebas, variantes, diagnósticos, síntomas. Sim embargo, hay una normativa muy limitada a la hora de acceder a este tipo de información por lo que limita su aplicación en el área. La bioinformática y las tecnologías en general, ayudan a mejorar el diagnóstico de una forma más eficaz, acceder a distintos tipos de pruebas...
Además, la rápida secuenciación del genoma del virus y la identificación de las distintas proteínas implicadas en el proceso de infección han ayudado al desarrollo de las vacunas. El conocimiento previo del genoma de los distintos virus SARS ha ayudado también al diagnóstico, sintomatología y desarrollo de tratamientos de una manera mucho más rápida y eficaz que si no hubiésemos tenido disponible este tipo de información.
A lo largo de la pandemia se ha producido un acercamiento entre los profesionales sanitarios y la información del estado, salud y monitorización del paciente. Además de la comunicación mundial entre los profesionales sanitarios acerca de pruebas, variantes, diagnósticos, síntomas. Sim embargo, hay una normativa muy limitada a la hora de acceder a este tipo de información por lo que limita su aplicación en el área. La bioinformática y las tecnologías en general, ayudan a mejorar el diagnóstico de una forma más eficaz, acceder a distintos tipos de pruebas...
Además, la rápida secuenciación del genoma del virus y la identificación de las distintas proteínas implicadas en el proceso de infección han ayudado al desarrollo de las vacunas. El conocimiento previo del genoma de los distintos virus SARS ha ayudado también al diagnóstico, sintomatología y desarrollo de tratamientos de una manera mucho más rápida y eficaz que si no hubiésemos tenido disponible este tipo de información.
Bioinformatics helps pinpoint evolutionary mutations of SARS-CoV-2
https://www.scienceboard.net/index.aspx?sec=sup&sub=cell&pag=dis&ItemID=669
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Good evening,
Throughout the pandemic there has been a rapprochement between healthcare professionals and patient status information, health, and monitoring. In addition to worldwide communication between healthcare professionals about tests, variants, diagnoses, symptoms. However, there are very limited regulations when it comes to accessing this type of information, which limits its application in this area. Bioinformatics and technologies in general, help to improve diagnosis in a more efficient way, access to different types of tests...
In addition, the rapid sequencing of the virus genome and the identification of the different proteins involved in the infection process have helped in the development of vaccines. Prior knowledge of the genome of the different SARS viruses has also helped in the diagnosis, symptomatology, and development of treatments in a much faster and more efficient way than if this type of information had not been available.
Throughout the pandemic there has been a rapprochement between healthcare professionals and patient status information, health, and monitoring. In addition to worldwide communication between healthcare professionals about tests, variants, diagnoses, symptoms. However, there are very limited regulations when it comes to accessing this type of information, which limits its application in this area. Bioinformatics and technologies in general, help to improve diagnosis in a more efficient way, access to different types of tests...
In addition, the rapid sequencing of the virus genome and the identification of the different proteins involved in the infection process have helped in the development of vaccines. Prior knowledge of the genome of the different SARS viruses has also helped in the diagnosis, symptomatology, and development of treatments in a much faster and more efficient way than if this type of information had not been available.
Bioinformatics helps pinpoint evolutionary mutations of SARS-CoV-2
https://www.scienceboard.net/index.aspx?sec=sup&sub=cell&pag=dis&ItemID=669
(Edited by Coral del Val Muñoz - original submission Wednesday, 9 February 2022, 10:16 PM)
(Edited by Coral del Val Muñoz - original submission Wednesday, 9 February 2022, 10:16 PM)
Buenos días a todos desde la Habana, Cuba
El impacto de la COVID-19 y el enfrentamiento a esta pandemia, vino a poner en un contexto relevante, y hasta popular, el uso de la Bioinformática. Lo que hasta ese momento era un campo donde los grandes resultados pasaban casi inadvertidos, se pusieron de moda y los grandes titulares hoy versan sobre las diferentes variantes del virus, los tratamientos o vacunas, las secuenciaciones genómicas para determinar las características de las diferentes cepas y todo a una velocidad que solo es posible gracias a la Bioinformática.
El impacto de la COVID-19 y el enfrentamiento a esta pandemia, vino a poner en un contexto relevante, y hasta popular, el uso de la Bioinformática. Lo que hasta ese momento era un campo donde los grandes resultados pasaban casi inadvertidos, se pusieron de moda y los grandes titulares hoy versan sobre las diferentes variantes del virus, los tratamientos o vacunas, las secuenciaciones genómicas para determinar las características de las diferentes cepas y todo a una velocidad que solo es posible gracias a la Bioinformática.
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Good morning everyone from Havana, Cuba.
The impact of COVID-19 and the confrontation to this pandemic, came to put in a relevant and even popular context, the use of Bioinformatics. What until then was a field where great results went almost unnoticed, became fashionable and the big headlines today are about the different variants of the virus, treatments or vaccines, genomic sequences to determine the characteristics of the different strains and all at a speed that is only possible thanks to Bioinformatics.
The impact of COVID-19 and the confrontation to this pandemic, came to put in a relevant and even popular context, the use of Bioinformatics. What until then was a field where great results went almost unnoticed, became fashionable and the big headlines today are about the different variants of the virus, treatments or vaccines, genomic sequences to determine the characteristics of the different strains and all at a speed that is only possible thanks to Bioinformatics.
(Editado por Coral del Val Muñoz - envío original jueves, 10 de febrero de 2022, 14:50)
Hola Lucia.
Totalmente de acuerdo contigo. Sin la información disponible, sin las tecnologías que se tienen al alcance, imposible lograr los avances con la rapidez que se han obtenido. Eso es definitivo.
Totalmente de acuerdo contigo. Sin la información disponible, sin las tecnologías que se tienen al alcance, imposible lograr los avances con la rapidez que se han obtenido. Eso es definitivo.
El Internet vino a revolucionarlo todo.Hi Lucia.
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I totally agree with you. Without the information available, without the technologies at hand, impossible to achieve the advances with the speed that have been obtained. That is definitive.
The Internet came to revolutionize everything.
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I totally agree with you. Without the information available, without the technologies at hand, impossible to achieve the advances with the speed that have been obtained. That is definitive.
The Internet came to revolutionize everything.
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(Editado por Coral del Val Muñoz - envío original martes, 15 de febrero de 2022, 10:26)
La epidemia ha revelado el importante papel de la Bioinformática y la ha puesto en la orden del día. Las ciencias de la computación han pasado a ser de una ciencia de apoyo a jugar un papel preponderante en el proceso de atencion a la misma, con la recopilacion diaria de informacion sobre la evolucion de la pandemia, los pronosticos, el procesamiento de la informacion. Asi como facilitado con sus herramientas el intercambio de informacion.
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The epidemic has revealed the important role of Bioinformatics and has put it on the agenda. Computer science has gone from being a supporting science to playing a leading role in the process of dealing with it, with the daily collection of information on the evolution of the pandemic, forecasts, information processing. As well as facilitating with its tools the exchange of information.
(Edited by Coral del Val Muñoz - original submission Wednesday, 9 February 2022, 10:57 PM)
Efectivamente Alfredo,
Uno de los grandes eventos ha sido la creación de repositorios accesibles a todo el mundo de manera que los cientificos pudieran avanzar mas rápido. se ha puesto de manifiesto que el acceso a la información de forma fácil acelera los procesos . Os dejo los repositorios de datos mas importantes de coronavirus:
* GISAID https://www.gisaid.org/ donde
se recogen todas las nuevas variantes, las secuencias, los avances epidemiológicos de las distintas variantes, ect..
* NCBI SARS-Cov2 Resources: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sars-cov-2/
Contiene publicaciones, secuencias, datos clínicos, clinical trials, ect..
* Litcovid: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/coronavirus/ .
LitCovid un centro de seguimiento de toda la literatura científica del virus.
*Johns Hopkins Coronavirus Resource Center https://coronavirus.jhu.edu/
A dashboard with global and national data about the pandemic and critical trends.
* Oxford Centre for Evidence-Based Medicine https://www.cebm.net/oxford-covid-19-evidence-service/
The CEBM has committed its skills and expertise in evidence synthesis and dissemination to the effort against the current COVID-19 pandemic.
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Indeed Alfredo,
One of the great events has been the creation of repositories accessible to everyone so that scientists could advance faster. It has become clear that easy access to information accelerates the processes. Here are the most important coronavirus data repositories:
* GISAID https://www.gisaid.org/ where
all the new variants, sequences, epidemiological advances of the different variants, ect... are collected.
* NCBI SARS-Cov2 Resources: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sars-cov-2/
Contains publications, sequences, clinical data, clinical trials, ect....
* Litcovid: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/coronavirus/ .
LitCovid a tracking center for all scientific literature on the virus.
*Johns Hopkins Coronavirus Resource Center https://coronavirus.jhu.edu/
A dashboard with global and national data about the pandemic and critical trends.
* Oxford Centre for Evidence-Based Medicine https://www.cebm.net/oxford-covid-19-evidence-service/
The CEBM has committed its skills and expertise in evidence synthesis and dissemination to the effort against the current COVID-19 pandemic.
Uno de los grandes eventos ha sido la creación de repositorios accesibles a todo el mundo de manera que los cientificos pudieran avanzar mas rápido. se ha puesto de manifiesto que el acceso a la información de forma fácil acelera los procesos . Os dejo los repositorios de datos mas importantes de coronavirus:
* GISAID https://www.gisaid.org/ donde
se recogen todas las nuevas variantes, las secuencias, los avances epidemiológicos de las distintas variantes, ect..
* NCBI SARS-Cov2 Resources: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sars-cov-2/
Contiene publicaciones, secuencias, datos clínicos, clinical trials, ect..
* Litcovid: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/coronavirus/ .
LitCovid un centro de seguimiento de toda la literatura científica del virus.
*Johns Hopkins Coronavirus Resource Center https://coronavirus.jhu.edu/
A dashboard with global and national data about the pandemic and critical trends.
* Oxford Centre for Evidence-Based Medicine https://www.cebm.net/oxford-covid-19-evidence-service/
The CEBM has committed its skills and expertise in evidence synthesis and dissemination to the effort against the current COVID-19 pandemic.
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Indeed Alfredo,
One of the great events has been the creation of repositories accessible to everyone so that scientists could advance faster. It has become clear that easy access to information accelerates the processes. Here are the most important coronavirus data repositories:
* GISAID https://www.gisaid.org/ where
all the new variants, sequences, epidemiological advances of the different variants, ect... are collected.
* NCBI SARS-Cov2 Resources: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sars-cov-2/
Contains publications, sequences, clinical data, clinical trials, ect....
* Litcovid: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/coronavirus/ .
LitCovid a tracking center for all scientific literature on the virus.
*Johns Hopkins Coronavirus Resource Center https://coronavirus.jhu.edu/
A dashboard with global and national data about the pandemic and critical trends.
* Oxford Centre for Evidence-Based Medicine https://www.cebm.net/oxford-covid-19-evidence-service/
The CEBM has committed its skills and expertise in evidence synthesis and dissemination to the effort against the current COVID-19 pandemic.
Hola Lucia, Alfredo
Lo que ha pasado con la pandemia producida por el virus SARS-CoV2 ha sido un hito en la historia de la humanidad. En ningun momento antes en la historia los científicos y las entidades a las que pertenecen habían puesto a disposición de todo el mundo la información que se ha ido descubriendo y los recursos generados. Tened en cuenta que hace dos años era un virus totalmente desconocido desde el punto de vista ómico y clinico.
Os dejo un artículo interesante sobre las herramientas que han ayudado a combatir el coronavirus:
https://cen.acs.org/biological-chemistry/infectious-disease/8-tools-that-helped-us-tackle-the-coronavirus/99/i3
En cuanto a los recursos esta situación ha puesto de manifiesto como la bioinformática y los supercomputadores son indispensables para acelerar la investigación. Un eemplo español ha sito el Barcelona Super Computing Center (BSC).
El BSC ha colaborado sobre todo en ver la influencia de las distintas mutaciones y la búsqueda de medicamentos y terapias inmunológicas contra el SARS-Cov-2
https://sciencebusiness.net/network-updates/bsc-uses-bioinformatics-ai-and-supercomputer-fight-against-coronavirus
Lo que ha pasado con la pandemia producida por el virus SARS-CoV2 ha sido un hito en la historia de la humanidad. En ningun momento antes en la historia los científicos y las entidades a las que pertenecen habían puesto a disposición de todo el mundo la información que se ha ido descubriendo y los recursos generados. Tened en cuenta que hace dos años era un virus totalmente desconocido desde el punto de vista ómico y clinico.
Os dejo un artículo interesante sobre las herramientas que han ayudado a combatir el coronavirus:
https://cen.acs.org/biological-chemistry/infectious-disease/8-tools-that-helped-us-tackle-the-coronavirus/99/i3
En cuanto a los recursos esta situación ha puesto de manifiesto como la bioinformática y los supercomputadores son indispensables para acelerar la investigación. Un eemplo español ha sito el Barcelona Super Computing Center (BSC).
El BSC ha colaborado sobre todo en ver la influencia de las distintas mutaciones y la búsqueda de medicamentos y terapias inmunológicas contra el SARS-Cov-2
https://sciencebusiness.net/network-updates/bsc-uses-bioinformatics-ai-and-supercomputer-fight-against-coronavirus
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Hello Lucia, Alfredo
What has happened with the pandemic produced by the SARS-CoV2 virus has been a milestone in the history of mankind. At no time before in history have scientists and the entities to which they belong made available to everyone the information that has been discovered and the resources generated. Keep in mind that two years ago it was a totally unknown virus from an economic and clinical point of view.
Here is an interesting article on the tools that have helped to combat the coronavirus:
https://cen.acs.org/biological-chemistry/infectious-disease/8-tools-that-helped-us-tackle-the-coronavirus/99/i3
In terms of resources, this situation has shown how bioinformatics and supercomputers are indispensable to accelerate research. A Spanish example is the Barcelona Super Computing Center (BSC).
What has happened with the pandemic produced by the SARS-CoV2 virus has been a milestone in the history of mankind. At no time before in history have scientists and the entities to which they belong made available to everyone the information that has been discovered and the resources generated. Keep in mind that two years ago it was a totally unknown virus from an economic and clinical point of view.
Here is an interesting article on the tools that have helped to combat the coronavirus:
https://cen.acs.org/biological-chemistry/infectious-disease/8-tools-that-helped-us-tackle-the-coronavirus/99/i3
In terms of resources, this situation has shown how bioinformatics and supercomputers are indispensable to accelerate research. A Spanish example is the Barcelona Super Computing Center (BSC).
https://sciencebusiness.net/network-updates/bsc-uses-bioinformatics-ai-and-supercomputer-fight-against-coronavirus
The BSC has collaborated mainly in looking at the influence of different mutations and the search for drugs and immunological therapies against SARS-Cov-2.
The BSC has collaborated mainly in looking at the influence of different mutations and the search for drugs and immunological therapies against SARS-Cov-2.
Hola Grupo
Soy del criterio que la pandemia abrió el camino por necesidad a la Bioinformática, que ya existía pero, a partir de esta epidemia y con las medidas implementadas para proteger la salud del contagio, no solo hubo que acudir al teletrabajo y la teleducación, la ciencia tuvo que desarrollarse a pasos acelerado en busca de la anhelada vacuna y el campo de la genética se hizo más imprescindible para alcanzar este logro y en breve tiempo, lo más importante es que llegó para quedarse, por lo que resulta imprescindible apropiarse de estas tecnologías para avanzar y evolucionar en medio de esta revolución.
Soy del criterio que la pandemia abrió el camino por necesidad a la Bioinformática, que ya existía pero, a partir de esta epidemia y con las medidas implementadas para proteger la salud del contagio, no solo hubo que acudir al teletrabajo y la teleducación, la ciencia tuvo que desarrollarse a pasos acelerado en busca de la anhelada vacuna y el campo de la genética se hizo más imprescindible para alcanzar este logro y en breve tiempo, lo más importante es que llegó para quedarse, por lo que resulta imprescindible apropiarse de estas tecnologías para avanzar y evolucionar en medio de esta revolución.
Buenos dias
Para profundizar estos progresos, resulta esencial que además de generar soluciones digitales se trabaje para promover el cierre de la brecha digital, ya que las diferencias en equipamiento y servicios de conectividad limitan el aprovechamiento de las TIC por parte de los centros de salud y pacientes.
Concientizarse sobre estas diferencias y los retos que estos implican debe ser una acción prioritaria, sobre todo si se consideran las transformaciones que en años venideros causarán las tecnologías disruptivas de la Revolución Industrial 4.0. Esto trasladado al campo de la salud, hará que esta se convierta en salud 4.0., es decir en sistemas de salud que cada vez más estarán basados en sistemas ciberfísicos. De acuerdo con el Director de la Escuela de Ingeniería Industrial, el Dr. Eldon Caldwell estos sistemas constituyen plataformas que permiten conectar y optimizar la operatividad del mundo virtual. Estos sistemas permiten la interconectividad, la visibilidad y la interoperabilidad de las plataformas digitales lo que a su vez repercute en las esferas económica, ambiental y social.
Avanzar hacia estas transformaciones es clave no solo para estimular un cambio de paradigma en la operación de nuestros sistemas de salud, sino también para estimular el uso y aprovechamientos que campos como la bioinformática ofrecen. En palabras del docente, investigador y Coordinador del Programa Sociedad de la Información y el Conocimiento (Prosic), Dr. Allan Orozco Solano, la bioinformática es un área disciplinar que se caracteriza por tener diferentes intersecciones con otras áreas del conocimiento. Es un campo interdisciplinario y transdisciplinario que ha contribuido al análisis de datos procedentes de la secuenciación genómica del SARS-CoV-2, de técnicas como la de biopsia líquida (para la identificación de células tumorales circulantes) y muy útil para analizar el patrón de datos sobre las diferencias en la respuesta inmune de pacientes en la actual coyuntura de crisis pandémica. Además, la Bioinformática colabora con la aplicación de nuevas técnicas como la Inteligencia Artificial en el análisis de datos genómicos en combinación con imágenes radiológicas y moleculares para el estudio del COVID-19 a un nivel más complejo.
http://www.prosic.ucr.ac.cr/noticias/prosic-facilito-un-espacio-para-la-reflexion-interdisciplinaria-en-los-usos-y-aplicaciones
Un saludo
Para profundizar estos progresos, resulta esencial que además de generar soluciones digitales se trabaje para promover el cierre de la brecha digital, ya que las diferencias en equipamiento y servicios de conectividad limitan el aprovechamiento de las TIC por parte de los centros de salud y pacientes.
Concientizarse sobre estas diferencias y los retos que estos implican debe ser una acción prioritaria, sobre todo si se consideran las transformaciones que en años venideros causarán las tecnologías disruptivas de la Revolución Industrial 4.0. Esto trasladado al campo de la salud, hará que esta se convierta en salud 4.0., es decir en sistemas de salud que cada vez más estarán basados en sistemas ciberfísicos. De acuerdo con el Director de la Escuela de Ingeniería Industrial, el Dr. Eldon Caldwell estos sistemas constituyen plataformas que permiten conectar y optimizar la operatividad del mundo virtual. Estos sistemas permiten la interconectividad, la visibilidad y la interoperabilidad de las plataformas digitales lo que a su vez repercute en las esferas económica, ambiental y social.
Avanzar hacia estas transformaciones es clave no solo para estimular un cambio de paradigma en la operación de nuestros sistemas de salud, sino también para estimular el uso y aprovechamientos que campos como la bioinformática ofrecen. En palabras del docente, investigador y Coordinador del Programa Sociedad de la Información y el Conocimiento (Prosic), Dr. Allan Orozco Solano, la bioinformática es un área disciplinar que se caracteriza por tener diferentes intersecciones con otras áreas del conocimiento. Es un campo interdisciplinario y transdisciplinario que ha contribuido al análisis de datos procedentes de la secuenciación genómica del SARS-CoV-2, de técnicas como la de biopsia líquida (para la identificación de células tumorales circulantes) y muy útil para analizar el patrón de datos sobre las diferencias en la respuesta inmune de pacientes en la actual coyuntura de crisis pandémica. Además, la Bioinformática colabora con la aplicación de nuevas técnicas como la Inteligencia Artificial en el análisis de datos genómicos en combinación con imágenes radiológicas y moleculares para el estudio del COVID-19 a un nivel más complejo.
http://www.prosic.ucr.ac.cr/noticias/prosic-facilito-un-espacio-para-la-reflexion-interdisciplinaria-en-los-usos-y-aplicaciones
Un saludo
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Good morning
To deepen this progress, it is essential that in addition to generating digital solutions, work is done to promote the closing of the digital divide, since the differences in equipment and connectivity services limit the use of ICT by health centers and patients.
Awareness of these differences and the challenges they imply should be a priority action, especially if we consider the transformations that will be caused in the coming years by the disruptive technologies of the Industrial Revolution 4.0. This, transferred to the field of healthcare, will lead to it becoming healthcare 4.0, i.e. healthcare systems that will increasingly be based on cyber-physical systems. According to the Director of the School of Industrial Engineering, Dr. Eldon Caldwell, these systems constitute platforms that make it possible to connect and optimize the operability of the virtual world. These systems enable interconnectivity, visibility and interoperability of digital platforms, which in turn has an impact on the economic, environmental and social spheres.
Moving towards these transformations is key not only to stimulate a paradigm shift in the operation of our health systems, but also to stimulate the use and exploitation that fields such as bioinformatics offer. In the words of the teacher, researcher and Coordinator of the Information and Knowledge Society Program (Prosic), Dr. Allan Orozco Solano, bioinformatics is a disciplinary area that is characterized by having different intersections with other areas of knowledge. It is an interdisciplinary and transdisciplinary field that has contributed to the analysis of data from the genomic sequencing of SARS-CoV-2, techniques such as liquid biopsy (for the identification of circulating tumor cells) and is very useful for analyzing the pattern of data on the differences in the immune response of patients in the current pandemic crisis. In addition, Bioinformatics collaborates with the application of new techniques such as Artificial Intelligence in the analysis of genomic data in combination with radiological and molecular imaging for the study of COVID-19 at a more complex level.
http://www.prosic.ucr.ac.cr/noticias/prosic-facilito-un-espacio-para-la-reflexion-interdisciplinaria-en-los-usos-y-aplicaciones
Greetings
To deepen this progress, it is essential that in addition to generating digital solutions, work is done to promote the closing of the digital divide, since the differences in equipment and connectivity services limit the use of ICT by health centers and patients.
Awareness of these differences and the challenges they imply should be a priority action, especially if we consider the transformations that will be caused in the coming years by the disruptive technologies of the Industrial Revolution 4.0. This, transferred to the field of healthcare, will lead to it becoming healthcare 4.0, i.e. healthcare systems that will increasingly be based on cyber-physical systems. According to the Director of the School of Industrial Engineering, Dr. Eldon Caldwell, these systems constitute platforms that make it possible to connect and optimize the operability of the virtual world. These systems enable interconnectivity, visibility and interoperability of digital platforms, which in turn has an impact on the economic, environmental and social spheres.
Moving towards these transformations is key not only to stimulate a paradigm shift in the operation of our health systems, but also to stimulate the use and exploitation that fields such as bioinformatics offer. In the words of the teacher, researcher and Coordinator of the Information and Knowledge Society Program (Prosic), Dr. Allan Orozco Solano, bioinformatics is a disciplinary area that is characterized by having different intersections with other areas of knowledge. It is an interdisciplinary and transdisciplinary field that has contributed to the analysis of data from the genomic sequencing of SARS-CoV-2, techniques such as liquid biopsy (for the identification of circulating tumor cells) and is very useful for analyzing the pattern of data on the differences in the immune response of patients in the current pandemic crisis. In addition, Bioinformatics collaborates with the application of new techniques such as Artificial Intelligence in the analysis of genomic data in combination with radiological and molecular imaging for the study of COVID-19 at a more complex level.
http://www.prosic.ucr.ac.cr/noticias/prosic-facilito-un-espacio-para-la-reflexion-interdisciplinaria-en-los-usos-y-aplicaciones
Greetings
(Edited by Coral del Val Muñoz - original submission Saturday, 12 February 2022, 9:21 AM)
Hola Maria Victoria,
estoy totalmente de acuerdo contigo. Estamos desperdiciando muchos recursos, mucha información y muchisimo material útil. Por ejemplo en España en cualquiera de los sitemas de salud existentes, hay biobancos pero no hay un repositorio general de datos. Es una odisea conseguir datos clinicos y muestras de pacientes. No hay un sistema estandarizado ni estipulado, el SAS en Andalucía está intentando avanzar en esa dirección pero la financiación que se está dedicando no es suficiente para montar un sistema de calidad que debería interelaccionar todas las partes, no solo para fines de investigación sino para fines clinicos igualmente.
Existen en este sentido iniciativas por parte de algunos gobiernos, por ejemplo uno de los mas avanzados es la iniciativa sueca de implantar un registro nacional de cáncer financiado por el gobierno. Es obligatorio que todos los proveedores de asistencia sanitaria de
Suecia notifiquen los nuevos casos de cáncer al Registro Sueco de Cáncer
(SCR), lo que significa que la base de datos abarca a toda la población
de Suecia. Es una base de datos centralizada que recoge datos del paciente; datos médicos generales y del tumor (citologia, muestras, ect..) y datos de seguimiento.
Esta base de dato supone un gran avance para el estudio y etiologia del cancer en una población, e iniciativas como estas deberían extenderse tambien a otras enfermedades: mentales, cardiovasculares, ect... siempre manteniendo el anonimato y al seguridad de la protección de datos.
Te dejo aquí un artículo al respecto:
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Hi Maria Victoria,
I totally agree with you. We are wasting a lot of resources, a lot of information and a lot of useful material. For example in Spain in any of the existing health systems, there are biobanks but there is no general data repository. It is an odyssey to obtain clinical data and patient samples. There is no standardized or stipulated system, the SAS in Andalusia is trying to move in that direction but the funding that is being devoted is not enough to set up a quality system that should interlink all the parts, not only for research purposes but also for clinical purposes.
There are initiatives in this direction by some governments, for example one of the most advanced is the Swedish initiative to implement a national cancer registry funded by the government. It is mandatory for all healthcare providers in Sweden to report new cancer cases to the Swedish Cancer Registry (SCR), which means that the database covers the entire population of Sweden. It is a centralized database that collects patient data; general medical and tumor data (cytology, specimens, etc.) and follow-up data.
This database is a breakthrough for the study and etiology of cancer in a population, and initiatives like these should also be extended to other diseases: mental, cardiovascular, ect.... always maintaining anonymity and the security of data protection.
https://www.all-can.org/efficiency-hub/the-swedish-cancer-registers-using-population-based-data-to-monitor-and-improve-cancer-control/
Pensaría que un rol único, primera vez en la historia que un virus de este calibre desafía los avances tecnológicos y dentro de los cuales tenemos la bioinformática. La cantidad de información que puedes encontrar acerca del COVID y en tan poco tiempo, nos prepara para retos mas difíciles. La bioinformático permitió conocer de mas cerca como funciona y que se puede recrear para contener un comportamiento biológico como lo fue el virus. Eso si teniendo en cuenta que la bioinformática tiene mas alcances, este es solo una profundización de una rama.
Esta pregunta me parece más para el debate final, una mejor pregunta sería: ¿Qué os ha parecido el módulo 1? Creo que ha tocado temas bastante interesantes y estoy a la espera de saber más.
Estimada Elizabeth,
esta pregunta no es una pregunta para un debate final sobre que te ha parecido el modulo 1. Es una linea de discusion como todas las otras para intentar haceros reflexionar sobre temas, herramientas, repositorios que no podemos cubrir en el curso por las limitaciones del modelo. En este caso la pregunta está enfocada a que reflexioneis sobre la necesidad de tener información disponible sin limites (ver respuesta a Alberto y Lucia), y poner en vuestro conocimiento todas las herramientas libres disponibles para el estudio del virus SARS-CoV-2. De hecho si todas las instituciones publicas y privadas no hubieran puesto a libre disposicion de los investigadores estos datos no hubieramos podido hacer nada con la bioinformática porque no habría información suficiente disponible, seguiriamos probablemente sin vacuna y desconociendo muchos de los mecanismos de acción del virus. Para que la bioinformatica y el aprendizaje supervisado funcionen hacen falta datos sobre los que aplicarlos.
Un saludo,
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Dear Elizabeth,
this question is not a question for a final debate. It is a line of discussion like all the others to try to make you reflect on topics, tools, repositories that we cannot cover in the course due to the limitations of the model. In this case the question is focused to make you think about the need to have information available without limits (see answer to Alberto and Lucia), to make you aware of all the free tools available for the study of the SARS-CoV-2 virus. In fact, if all public and private institutions had not made these data freely available to researchers, we would not have been able to do anything with bioinformatics because there would not be enough information available. For bioinformatics and supervised learning to work you need data on which to apply them.
Best regards,
esta pregunta no es una pregunta para un debate final sobre que te ha parecido el modulo 1. Es una linea de discusion como todas las otras para intentar haceros reflexionar sobre temas, herramientas, repositorios que no podemos cubrir en el curso por las limitaciones del modelo. En este caso la pregunta está enfocada a que reflexioneis sobre la necesidad de tener información disponible sin limites (ver respuesta a Alberto y Lucia), y poner en vuestro conocimiento todas las herramientas libres disponibles para el estudio del virus SARS-CoV-2. De hecho si todas las instituciones publicas y privadas no hubieran puesto a libre disposicion de los investigadores estos datos no hubieramos podido hacer nada con la bioinformática porque no habría información suficiente disponible, seguiriamos probablemente sin vacuna y desconociendo muchos de los mecanismos de acción del virus. Para que la bioinformatica y el aprendizaje supervisado funcionen hacen falta datos sobre los que aplicarlos.
Un saludo,
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Dear Elizabeth,
this question is not a question for a final debate. It is a line of discussion like all the others to try to make you reflect on topics, tools, repositories that we cannot cover in the course due to the limitations of the model. In this case the question is focused to make you think about the need to have information available without limits (see answer to Alberto and Lucia), to make you aware of all the free tools available for the study of the SARS-CoV-2 virus. In fact, if all public and private institutions had not made these data freely available to researchers, we would not have been able to do anything with bioinformatics because there would not be enough information available. For bioinformatics and supervised learning to work you need data on which to apply them.
Best regards,
La Bioinformática ha jugado un rol importante y determinante frente a la pandemia de Covid 19, debido a su razón de ser que no es más que comprender biológicamente el surgimiento de este virus a través del uso de datos, de las ciencias ómicas y sus omas, valga la redundancia. Ha sido imprescindible el uso de la bioinformática para entender el desarrollo histórico-lógico de este virus con su primera aparición siendo solamente SARS en el 2003 y convirtiendo en SARS –COV- 2, más conocido como Covid-19. Todo los ensayos clínicos o experimentos realizados para comprender la síntesis de este virus, el desarrollo de vacunas para contrarrestar o inmunizar al organismo, todo esto son roles de la bioinformática. El uso de la informática computacional ha jugado un papel importante y decisivo en el estudio y secuenciación de genomas, para la creación de fármacos que apoyen a las personas infectadas con el virus. Ha sido un largo camino recorrido que aún no concluye, y en el cual esta ciencia que es la biología molecular va acompañando al proceso como herramienta de compresión biológica.
Con la aparición del SARS-CoV2 y esta pandemia, la bioinformática ha jugado un papel muy importante, tanto así que en pocos meses (mucho menos tiempo del esperado) se ha descubierto el ADN del virus. Se pudo determinar el comportamiento del mismo y por ende, se descubre la mejor forma de combatirlo (vacuna). Los especialistas han puesto al servicio de la humanidad su conocimiento y la tecnología ha sido el medio por el cual, gracias al esfuerzo de estos "héroes" tenemos una vacuna, que nos colabora a combatir este nefasto virus.
Adicionalmente a todo este estudio, ha sido la forma en que se ha compartido la información, todo lo que se ha descubierto, los científicos lo han compartido con todo el mundo. Lo que conlleva a una verdadera colaboración sanitaria para combatir el SARS-CoV2.
Adicionalmente a todo este estudio, ha sido la forma en que se ha compartido la información, todo lo que se ha descubierto, los científicos lo han compartido con todo el mundo. Lo que conlleva a una verdadera colaboración sanitaria para combatir el SARS-CoV2.
pues no lo se y espero con este curso dar respuesta a tu pregunta
La compleja lucha contra la crisis sanitaria generada por el virus de reciente aparición COVID-19, nos ha revelado el rol fundamental de la ciencia frente a estos escenarios y la importancia de invertir en investigación científica para enfrentar con estrategias eficientes y eficaces este tipo de crisis. Una de las áreas de investigación crucial en la actualidad es la bioinformática que, a través de metodologías computacionales, aporta información sobre las relaciones evolutivas, características visibles o funcionales de un organismo. Así también podemos identificar genes o proteínas que nos permiten el descubrimiento de nuevos medicamentos.
La bioinformática es una herramienta de aproximación a la comprensión biológica, ésta hace uso de datos e información multidisciplinares, los que pueden incluir resultados de ensayos experimentales o clínicos. En el contexto actual, la bioinformática tiene un papel fundamental tanto en la mejor comprensión de la biología del SARS-CoV-2, como en el desarrollo de vacunas y medicamentos para el tratamiento del COVID-19.
La bioinformática es una herramienta de aproximación a la comprensión biológica, ésta hace uso de datos e información multidisciplinares, los que pueden incluir resultados de ensayos experimentales o clínicos. En el contexto actual, la bioinformática tiene un papel fundamental tanto en la mejor comprensión de la biología del SARS-CoV-2, como en el desarrollo de vacunas y medicamentos para el tratamiento del COVID-19.
Es obvio que la bioinformática ha ocupado un papel fundamental en el tema del COVID, se puede decir que ha sido imprescindible para saber cual es el origen del virus y cuales podrían ser sus posibles comportamientos. Ha sido una ciencia que no estaba valorada y que se ha visto que es muy necesaria.
Buenas a todos,
En mi opinión, la Bioinformática ha jugado un papel primordial en la lucha contra el SARS-CoV2, la cual mediante técnicas de secuenciación masiva es posible obtener de forma simultánea miles genomas del virus, con la utilizando diferentes softwares bioinformáticos para analizar y comparar estas secuencias, aportando datos que permiten conocer las características del virus, el seguimiento de su evolución y propagación, su ciclo y maquinaria vital. Mediante la realización de estudios filogenéticos es posible entender las similitudes y diferencias con otros virus, así como entender los mecanismos de entrada del virus en la célula e identificar opciones potenciales de intervención. Tal es la importancia de estos estudios que ya son miles de secuencias genómicas compartidas por científicos de todo el mundo en GISAID abiertas al público para su estudio y análisis.
Dicho esto, la Bioinformática se puede considerar indispensable para poner fin a la pandemia COVID19 que nos azota hasta la actualidad.
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Hello everyone,
In my opinion, Bioinformatics has played a key role in the fight against SARS-CoV2, which through massive sequencing techniques it is possible to obtain thousands of virus genomes simultaneously, with the use of different bioinformatics software to analyze and compare these sequences, providing data that allows knowing the characteristics of the virus, monitoring its evolution and spread, its cycle and vital machinery. By conducting phylogenetic studies, it is possible to understand the similarities and differences with other viruses, as well as to understand the mechanisms of entry of the virus into the cell and to identify potential options for intervention. Such is the importance of these studies that there are already thousands of genomic sequences shared by scientists from all over the world in GISAID open to the public for study and analysis.
That said, Bioinformatics can be considered essential to put an end to the COVID19 pandemic that plagues us to this day.
En mi opinión, la Bioinformática ha jugado un papel primordial en la lucha contra el SARS-CoV2, la cual mediante técnicas de secuenciación masiva es posible obtener de forma simultánea miles genomas del virus, con la utilizando diferentes softwares bioinformáticos para analizar y comparar estas secuencias, aportando datos que permiten conocer las características del virus, el seguimiento de su evolución y propagación, su ciclo y maquinaria vital. Mediante la realización de estudios filogenéticos es posible entender las similitudes y diferencias con otros virus, así como entender los mecanismos de entrada del virus en la célula e identificar opciones potenciales de intervención. Tal es la importancia de estos estudios que ya son miles de secuencias genómicas compartidas por científicos de todo el mundo en GISAID abiertas al público para su estudio y análisis.
Dicho esto, la Bioinformática se puede considerar indispensable para poner fin a la pandemia COVID19 que nos azota hasta la actualidad.
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Hello everyone,
In my opinion, Bioinformatics has played a key role in the fight against SARS-CoV2, which through massive sequencing techniques it is possible to obtain thousands of virus genomes simultaneously, with the use of different bioinformatics software to analyze and compare these sequences, providing data that allows knowing the characteristics of the virus, monitoring its evolution and spread, its cycle and vital machinery. By conducting phylogenetic studies, it is possible to understand the similarities and differences with other viruses, as well as to understand the mechanisms of entry of the virus into the cell and to identify potential options for intervention. Such is the importance of these studies that there are already thousands of genomic sequences shared by scientists from all over the world in GISAID open to the public for study and analysis.
That said, Bioinformatics can be considered essential to put an end to the COVID19 pandemic that plagues us to this day.
